Une mésentente règne au sein du syndicat des magistrats du Burundi. Une partie des magistrats ne reconnait pas la représentation à la tête du SYMABU depuis le mois de février. Toutefois, Jean Pierre Munyembari réclame la présidence du syndicat pour avoir été élu par ses pairs et réfute toute idée de nouvelles élections, telles que le réclame les magistrats.

Selon différents procès-verbaux, il s’est tenu à Gitega le 16 février 2014, une assemblée générale élective du président du syndicat SYMABU qui porta à la tête Jean Marie Munyembari et Aimable Ntaconzoba ayant été élu comme vice-président. Selon le statut régissant le SYMABU, les deux élus présentent au congrès 5 membres du bureau exécutif national qui vont être approuvé par l’Assemblée séance tenante. Selon l’un des deux procès-verbaux établi par la commission électorale, le comité exécutif national présenté à l’Assemblée a été désapprouvé et l’article 23 du statut régissant le SYMABU indique que le rejet du bureau exécutif 2 fois successives par le congrès oblige le président élu à démissionner. Dans ce cas, il est organisé un congrès extraordinaire électif dans un délai ne dépassant pas un mois. Paradoxalement, deux procès-verbaux ont été signés par le président de la commission électorale, Septime Kimamba. L’un attestant la bonne tenue des élections l’autre affirmant qu’une polémique s’est observée liée au mode d’approbation et que par conséquent de nouvelles élections vont être organisées. Pour Jean Pierre Munyembari qui dit être président du SYMABU, les organes du syndicat sont tous là et sont fonctionnels. Il indique en outre ne pas être au courant de ce deuxième procès-verbal.

Certains magistrats avaient annoncé que le manque d’organes légaux bloque certaines réclamations des magistrats car n’ayant pas d’interlocuteurs reconnus par tous.